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Diferenças
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projetos:reproducibleresearch [2014/03/17 17:56] joel [Reproducible Research] |
projetos:reproducibleresearch [2014/03/17 18:04] (atual) joel [Reproducible Research] |
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|---|---|---|---|
| Linha 50: | Linha 50: | ||
| \section{A Box Plot} | \section{A Box Plot} | ||
| - | <<results='hide',boxplot,fig.show='hide'>>= | + | <<boxplot>>= |
| # building a box plot | # building a box plot | ||
| boxplot(iris$Sepal.Length~iris$Species) | boxplot(iris$Sepal.Length~iris$Species) | ||
| @ | @ | ||
| - | \includegraphics{figure/boxplot.pdf} | + | |
| \section{A Table} | \section{A Table} | ||
| Linha 80: | Linha 81: | ||
| </code> | </code> | ||
| - | Save this file as report.Rnw and run in R the following commands : | + | Save the commands above into a file called report.rnw and compile it into a LaTeX document according to the commands below. |
| <code> | <code> | ||
| library(knitr) | library(knitr) | ||
| knit("report.rnw") | knit("report.rnw") | ||
| - | system("tex2pdf report.tex") | ||
| </code> | </code> | ||
| + | |||
| + | This will generate a .tex file that can be processed by a LaTex editor! | ||
| + | |||
| + | For linux and mac users, you can run : | ||
| + | |||
| + | <code> | ||
| + | > tex2pdf report.tex | ||
| + | </code> | ||
| + | |||
| + | to convert the result into a pdf | ||
