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disciplinas:lce5715-2016 [2016/08/12 09:11] paulojus criada |
disciplinas:lce5715-2016 [2016/10/07 12:07] paulojus |
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| - | ====== LCE-5715 : Métodos computacionais para inferência estatística ====== | + | ====== LCE-5715 - Métodos Computacionais para Inferência com Aplicações em R ====== |
| + | O objetivo da disciplina é apresentar e discutir os principais métodos computacionais utilizados em inferência estatística. Prover complemento computacional para disciplinas do programa. Capacitar participantes a desenvolver algoritmos e escrever códigos com vistas a implementações de modelos e extensões não contempladas em implementações de software. | ||
| + | |||
| + | ====== Programa Analítico ====== | ||
| + | - Programação da função de verossimilhança para variáveis discretas, contínuas ou misturas. | ||
| + | - Programação do algoritmo de Newton Raphson. | ||
| + | - Programação do algoritmo Scoring de Fisher. | ||
| + | - Programação do algoritmo do tipo EM. | ||
| + | - Programação do algoritmo Gauss-Newton. | ||
| + | - Métodos de aproximação de integrais Monte Carlo, Boostraping. | ||
| + | - Exploração numérica da verossimilhança, verossimilhanças perfilhadas e marginais. | ||
| + | - Métodos para modelos com efeitos aleatórios. | ||
| + | - MCMC – Monte Carlo via Cadeias de Markov. | ||
| + | |||
| + | ===== Detalhes da oferta da disciplina ===== | ||
| + | - **Período:** segundo semestre de 2016, no programa de pós graduação de [[http://www.esalq.usp.br/pg/11134.htm|estatística e experimentação agronômica]] da ESALQ/USP | ||
| + | - **Matrículas e informações:** com Solange de Assis Paes Sabadin (''solange.sabadin **''AT''** usp.br'') ou Mayara Segatto (''mayarasegatto'' **AT** ''gmail.com'') na secretaria do programa, Telefone: (19) 3429-4144, ramal 231 | ||
| + | - **Professores Responsáveis:** | ||
| + | - Roseli Aparecida Leandro (ESALQ/USP) | ||
| + | - [[http://www.leg.ufpr.br/~paulojus|Paulo Justiniano Ribeiro Jr]], ([[http://www.leg.ufpr.br|LEG: Laboratório de Estatística e Geoinformação]]) | ||
| + | - **Horários e Locais:** | ||
| + | * As aulas serão na sala 311 | ||
| + | * Horário: Sextas, 8:00 às 12:00 | ||
| + | - **Datas especiais:** <WRAP> | ||
| + | | 12/08/2016 |24/11/2016 | | ||
| + | |Início das aulas |Último dia de aula | | ||
| + | </WRAP> | ||
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| + | /* **Avaliação:** clique para ver a [[disciplinas:geoesalq:tabela2008|tabela dos trabalhos recebidos]] */ | ||
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| + | /* | ||
| + | ===== Programa da Disciplina ===== | ||
| + | |||
| + | Por enquanto verifique o conteúdo [[https://uspdigital.usp.br/janus/componente/catalogoDisciplinasInicial.jsf?action=3&sgldis=LCE5715|na página da disciplina no sistema JANUS]]. | ||
| + | */ | ||
| + | |||
| + | ===== Referências Bibliográficas ===== | ||
| + | - Material básico: capítulos 1 a 5 de: | ||
| + | - [[http://www.leg.ufpr.br/mcie|Bonat et al.]] (curso do SINAPE/2012, pdf com versão atualizada) | ||
| + | - Materiais adicionais | ||
| + | - Albert, J. (2009) Bayesian Computation with R. Second Edition. New York: Springer. | ||
| + | - Braun, W. J. e Murdoch, D. J. (2007). A First Course in Statistical Programming with R. Cambridge University Press. | ||
| + | - Gamerman, D. e Lopes, H. F. (2006). Markov Chain Monte Carlo: Stochastic Simulation for Bayesian Inference. Second Edition. London: Chapman & Hall/CRC Press. | ||
| + | - McLachlan, G. e Krishnan, T. (1996). The EM Algorithm and Extensions. John Wiley & Sons, New York. | ||
| + | - Rizzo, M. (2008). Statistical Computing with R. CRC/Chapman Hall. | ||
| + | - Robert, C. e Casella, G. (2010). Introducing Monte Carlo Methods with R. New York: Springer. | ||
| + | - Robert, C. e Casella, G. (2004). Monte Carlo Statistical Methods (2a edição). Springer. | ||
| + | - Tanner, M.A.(1996). Tools for statistical inference methods for the exploration of posterior distributions and likelihood functions. Springer, New York. | ||
| + | - Venables, W. N. e Ripley, B. D. (2002) Modern Applied Statistics with S. Fourth Edition. New York: Springer-Verlag. | ||
| + | /* [[disciplinas:verao2007:bibliografia|Lista de referências para o curso]] */ | ||
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| + | ===== Materiais do Curso ===== | ||
| + | /* {{:disciplinas:lce5715-2014:01-02-apresentacao-verossimilhanca.pdf|Slides da 1a e 2a aulas}} (Verossimilhança) * | ||
| + | /* - Arquivo de comandos: {{:disciplinas:lce5715-2014:exponencial.r|exemplo da exponencial}} * | ||
| + | /* - Texto sobre {{:disciplinas:lce5715-2014:gamma.pdf|inferência na distribuição Gamma}} * | ||
| + | /* {{:disciplinas:lce5715-2014:03-apresentacao-regressao.pdf|Slides da 3a aula}} (regressão) * | ||
| + | /* - [[http://www.tandfonline.com/doi/full/10.1080/02664763.2014.922168#.VB9mFCVKaXo|Link para artigo da //count-gamma//]] e veja também a página de [[publications:papercompanions:zeviani-jas2014|complementos online do artigo]] (se não conseguir acesso acima veja [[http://arxiv-web3.library.cornell.edu/abs/1312.2423|uma versão preliminar do texto.]]) * | ||
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| + | __**ATENÇÃO:**__ arquivos/páginas poderão atualizados durante o curso. | ||
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| + | ===== Programas computacionais ===== | ||
| + | * Programa básico do curso | ||
| + | - [[http://www.r-project.org|The R project for Statistical Computing]]: página do programa **R** | ||
| + | - [[http://www.leg.ufpr.br/~paulojus/embrapa/Rembrapa/|Um material sobre o uso do R]] | ||
| + | * Recursos auxiliares | ||
| + | - [[http://www.math.ilstu.edu/dhkim/Rstuff/Rtutor.html|Uma página interessante]] com uma introdução ao R | ||
| + | - [[http://www.rstudio.org|R-Studio]] um ambiente para facilitar uso do R | ||
| + | - [[software:rbr|R-br]] é a lista de discussão em português sobre o uso do R | ||
| + | * **Programas para matemática simbólica** | ||
| + | - [[http://www.wolframalpha.com/|Wolfram alpha]] | ||
| + | - [[http://maxima.sourceforge.net/|Maxima]] (e interface [[http://andrejv.github.com/wxmaxima/|wxmaxima]]) | ||
| + | * [[http://maxima.sourceforge.net/docs/manual/pt/maxima.html|Manual em português]] | ||
| + | * [[http://www.youtube.com/profile?user=matematicadigital&view=videos|Vídeos]] | ||
| + | - [[http://axiom.axiom-developer.org/|Axiom]] | ||
| + | - [[http://sympy.org/|Sympy]] | ||
| + | * [[http://code.google.com/p/rsympy/|Interface do R]] com o Sympy | ||
| + | * [[http://cran.r-project.org/web/packages/rSymPy/rSymPy.pdf|Manual do R-Sympy]] | ||
| + | - [[http://yacas.sourceforge.net|Yacas]] | ||
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| + | ===== Histórico das aulas ===== | ||
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| + | ^Dia ^Conteúdo ^Materiais ^Comentário ^Atividades ^ | ||
| + | |12/08 |Apresentação do curso, professores e participantes. Introdução ao uso do programa R |{{:disciplinas:lce5715-2016:aula1.r|Comandos do R}} |Profa Roseli, Paulinho remoto | | | ||
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| + | |16/09 |Inferência com verossimilhança |Cap 1 e 2 |Prof Paulinho presencial |[[#16/09]] | | ||
| + | |07/10 |Inferência com dois (ou mais) parâmetros e modelos de regressão|Cap 3 e 4 |Prof Paulinho presencial |[[#08/10]] | | ||
| + | |||
| + | === 16/09 === | ||
| + | * Considere a distribuição exponencial | ||
| + | * Simular um conjunto de (15) dados | ||
| + | * Obter gráficos de verossimilhança, log-verossimilhança, verossimilhança relativa e função deviance **para as 2 parametrizações** usuais da exponencial | ||
| + | * Obter em cada caso IC's | ||
| + | * assintóticos para parametrição usada | ||
| + | * assintóticos de uma transformação transformados diretamente para outra | ||
| + | * assintóticos de uma transformação transformados (método delta) para outra | ||
| + | * por corte na função deviance (ou alguma outra) | ||
| + | * por corte na função deviance (ou alguma outra) e diretamente transformado para outra parametrização | ||
| + | * Fixar um valor arbitrátio e fazer testes da razão de verossimilhança, Wald e score | ||
| + | * Repetir problema anterior para outras distribuições (Poisson, Beta, Gamma etc). No caso de distribuição de 2 parâmetros, fixar um deles e fazer inferência sobre o outro. | ||
| + | * Verificar como foram feitos os cálculos de relação entre os "pontos de corte" para definição de intervalos baseados em verossimilhança mostrados na tabela do texto/slides do curso | ||
| + | * Alguns scripts: | ||
| + | * {{:disciplinas:lce5715-2016:binom.r|binomial}} (introdução) | ||
| + | * {{:disciplinas:lce5715-2016:binomvero.r|binomial}} (análises) | ||
| + | * {{:disciplinas:lce5715-2016:exponencial.r|exponencial}} | ||
| + | |||
| + | === 08/10 === | ||
| + | - scripts mostrados em aula | ||
| + | - {{:disciplinas:lce5715-2016:poisson.r|Poisson}} | ||
| + | - {{:disciplinas:lce5715-2016:pplik.r|Processo Pntual}} | ||
| + | - {{:disciplinas:lce5715-2016:ar1.r|AR1}} | ||
| + | |||
| + | ===== Espaço Aberto ===== | ||
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| + | [[disciplinas:lce5715-2016:aberto|Página aberta]] para edição pelos participantes do curso. | ||
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| + | ===== Atividades dos Participantes ===== | ||
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| + | /* [[disciplinas:geoesalq:atividades2012|Informações e Registro]] das atividades do curso * | ||
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| - | [[http://www.leg.ufpr.br/mcie|Material para o curso]] | ||
