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dicas:lcpad [2011/10/06 18:39]
paulojus
dicas:lcpad [2015/06/12 16:05] (atual)
paulojus [Uso do R no LCPAD]
Linha 37: Linha 37:
   * para acessar uma delas use o ''​rlogin''<​code>​   * para acessar uma delas use o ''​rlogin''<​code>​
 lcpad % rlogin bl03 lcpad % rlogin bl03
-a03 %+bl03 %
 </​code>​ </​code>​
  
Linha 43: Linha 43:
  
 ==== Uso do R no LCPAD ==== ==== Uso do R no LCPAD ====
 +
 Existem duas versões do programa ''​R''​ disponíveis no LCPAD Existem duas versões do programa ''​R''​ disponíveis no LCPAD
   - Uma versão disponível para acesso **apenas na servidora ''​lcpad.ufpr.br''​** que pode ser usada inclusive interativamente e graficamente. Para iniciar esta versão do R em modo interativo digite:<​code>​   - Uma versão disponível para acesso **apenas na servidora ''​lcpad.ufpr.br''​** que pode ser usada inclusive interativamente e graficamente. Para iniciar esta versão do R em modo interativo digite:<​code>​
-% R </​code>​ +/​home/​users/​est/​paulojus/​R/​bin/​R </​code>​ 
-e para modo BATCH o comando usual e acompanha o andamento do //job// com:<​code>​+Voce pode (deve) crirar um //​alias// ​para o comando acima no sistema<​code>​ 
 +% alias R='/​home/​users/​est/​paulojus/​R/​bin/​R'​ 
 +</​code>​ 
 + 
 +Para modo BATCH o comando usual e acompanha o andamento do //job// com:<​code>​
 % R CMD BATCH seu_programa.R & % R CMD BATCH seu_programa.R &
 % tail -f seu_programa.Rout % tail -f seu_programa.Rout
 </​code> ​ </​code> ​
   - Nas demais máquinas do LCPAD não é possivel utilizar o R gráfico e foi compilada uma versão sem suporte gráfico do ''​R''​ que chamamos de ''​Rnox''​. Par usar esta versão voce deve primeiro criar um //alias// nos seu arquivo ''​.bashrc''​ e/ou ''​.zshrc''​ (se voce copiou estes arquivos da conta de PJ isto não é necessário pois o //alias// já está nos arquivos copiados): <​code>​   - Nas demais máquinas do LCPAD não é possivel utilizar o R gráfico e foi compilada uma versão sem suporte gráfico do ''​R''​ que chamamos de ''​Rnox''​. Par usar esta versão voce deve primeiro criar um //alias// nos seu arquivo ''​.bashrc''​ e/ou ''​.zshrc''​ (se voce copiou estes arquivos da conta de PJ isto não é necessário pois o //alias// já está nos arquivos copiados): <​code>​
-alias Rnox="​nice -n 19 /​home/​users/​est/​paulojus/​R/​bin/​R" ​+alias Rnox="​nice -n 19 /​home/​users/​est/​paulojus/​Rnox/​bin/​R" ​
 source .bashrc source .bashrc
 source .zshrc source .zshrc
Linha 79: Linha 84:
  
 No caso do ''​Rnox''​ esta última solução pode ser //​automatizada//​ mudando o seu //​alias// ​ em ''​.zshrc''​ para:<​code>​ No caso do ''​Rnox''​ esta última solução pode ser //​automatizada//​ mudando o seu //​alias// ​ em ''​.zshrc''​ para:<​code>​
-alias Rnox="​nice -n 19 nohup /​home/​users/​est/​paulojus/​R/​bin/​R" ​+alias Rnox="​nice -n 19 nohup /​home/​users/​est/​paulojus/​Rnox/​bin/​R" ​
 source .zshrc source .zshrc
 </​code>​ </​code>​

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