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Minicurso: Estatística Experimental com Software R

Minicurso: Estatística Experimental com Software R

Introdução

O planejamento, execução e análise de experimentos é uma competência do profissional das Ciências Agrárias. Para agilizar a análise dos dados obtidos nos experimentos, a utilização de recursos computacionais pode ser de grande utilidade. O curso objetiva analisar dados vinculados a estatística experimental, utilizando o software livre R.

Ministrantes:

Cronograma

Hora Segunda
10/05/2010
Terça
11/05/2010
Quarta
12/05/2010
Quinta
13/05/2010
Sexta
14/05/2010
8 às 11:30 Revisão de estatística básica
- Momentos de 1°, 2°, 3° e 4° ordem
- Modelos probabilísticos
- Intervalos de confiança
- Teste de Hipótese
Introdução a o software R
Instalação
Classes de dados
Manipulação de dados
Operadores lógicos
Seqüências
Manipulação de banco de dados
Delineamento em Blocos ao Acaso
Teste de Scott-Knott
Contrastes
Transformação de Dados
Delineamento em parcela sub-dividida
- Estudo do efeito principal
- Estudo dos efeitos secundários
- Estudo da interação entre os efeitos
Visita ao IAPAR*
Ministrante Prof. Paulo Justiniano Ribeiro Junior Prof. Paulo Justiniano Ribeiro Junior Éder Borges da Silva
Renato Gonçalves Oliveira
Éder Borges da Silva
Renato Gonçalves Oliveira
Prof. Volnei Pauletti
Prof. Juarez Gabardo
Local: LABEST LABEST LABEST LABEST Londrina
Almoço
13:30 ás 17:30 Desenvolvimento e instalação de experimentos¹
Delineamentos experimentais²
Tendências futuras na experimentação²
Uso de modelos mistos na experimentação³
Análise de Variância
- Definição
- Pressupostos
Delineamento Inteiramente Casualizado
Teste de Tukey
Experimento em esquema Fatorial
- Estudo do efeito principal
- Estudo das interações duplas
- Estudo das interações triplas
Análise de regressão linear
- Univariada
- Múltipla
- Superfície de resposta
Análise de Regressão não linear
Visita à Embrapa Soja
Ministrante Prof. Volnei Pauletti¹
Éder Borges da Silva²
Renato Gonçalves Oliveira²
Prof. Ricardo Augusto³
Prof. Jomar Camarinha Éder Borges da Silva
Renato Gonçalves Oliveira
Éder Borges da Silva
Renato Gonçalves Oliveira
Prof. Volnei Pauletti
Prof. Juarez Gabardo
Local: LABEST LABEST LABEST LABEST Londrina

* Viagem sai do agrárias Quinta-feira às 23:30 e retornando sábado ás 7:00.

Materiais

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Material a ser utlizado durante o curso

  1. Materiais aulas R Prof. Paulo Justiniano
  2. Apresentação Prof. Volnei Pauletti
  3. Apresentações
  4. Exemplos de análises de diferentes tipos de experimentos
    1. Delineamento Inteiramente Casualizado
    2. Script Geral do curso
    3. Delineamento Blocos ao Acaso
    4. Transformação de dados
    5. Esquema Fatorial
    6. Delineamento em Parcelas sub-divididas
    7. Regressão Linear
      • Dados no Script
    8. Regressão Não Linear
      • Dados no Script
    9. Algumas formas de salvar análises e figuras

## Salvando arquivo com resultados de análises
sink("AnovaDIC.txt")# Com este comando é criado um arquivo de texto no Workspace do R
dados.av<-aov(resp~trat)
summary(dados.av)#Todas as saidas que apareceriam na tela agora vão ser salvas no arquivo
sink()#Com este comando é fechado o arquivo texto com os resultados das analises
 
## Salvando graficos
## em jpg
jpeg("grafico1.jpg")
plot(x,y)
dev.off()
 
## em pdf
pdf("grafico2.pdf")
plot(x,y)
dev.off()

Exercicios Extras

Delineamento Inteiramente Casualizado

Com o conjunto de dados "exemplo01E.txt", dados retirados do livro "Estatística Aplicada a pesquisa agícola" de Zimmermann (2006), o exemplo encontra-se na pagina 62 e foi modificado, os tratamentos são:

  1. Solo sem cultivo previo de arroz, com furadam
  2. Solo sem cultivo previo de arroz, sem furadam
  3. Solo sem cultivo previo de arroz, com herbicida
  4. Solo sem cultivo previo de arroz, sem herbicida
  5. Solo com cultivo previo de arroz, com herbicida

A variavel é materia seca por planta, em gramas, o experimento foi conduzido em casa de vegetação em vasos. Dado O exemplo, obtenha: a análise exploratoria dos dados, análise de variância, e teste de comparação multipla caso for necessario, e obtenha a comparação por contraste:

  1. Com versus sem cultivo previo
  2. Furadam versus herbicida
  3. Sem furadam versus sem herbida

Delineamento em Blocos ao Acaso

Com o conjunto de dados "exemplo02E.txt" que contem dados de produtividade de trigo sobre diferentes doses de esterco liquido bovino, foi conduzido com 4 blocos e 4 doses (0,60,120,180). Obtenha: Análise exploratoria, Análise de variância, transformação via Box-Cox, teste de comparação multipla, regressão linear, e recomendações.

Delineamento Quadrado Latino

A análise de variância de um experimento conduzido no Delineamento em Quadrado Latino. O experimento é sobre produção de grãos de feijão (Kg/parcela) de diferentes variedades de feijão. (Zimmermann) Obtenha: Análise exploratoria, Análise de variância, teste de comparação multipla, e recomendações.

Fatorial 2x3 em DIC

O experimento refere-se a um estudo de mudas de Eucalipto onde foi estudado o crescimento (cm) de duas espécies (E1 e E2) em três tipos de recipiente (R1, R2 e R3). O delineamento foi completamente casualizado com 4 repetições. extraido "Experimentação Agricola" Kronha & Banzatto pg 106. Obtenha: Análise exploratoria, Análise de variância, Desdodramento da Interação, teste de comparação multipla, e recomendações.

Fatorial 2x2x2 em DBA

O exemplo a seguir é de um delineamento em blocos completos casualizados com 6 repetições no esquema fatorial 2x2x2, no qual foi estudado o efeito da adubação mineral no cafeiro, com Nitrogênio (N), Fósforo (P) e Potássio(K), sendo cada contendo 2 níveis: 0 (ausência) e 1 (presença). Cada parcela era constituída por 12 covas no espaçamento 3,5 x 2,5, com uma área de 105 m², sendo que os dados obtidos foram transformados para kg/ha. Extraido "Experimentação Agricola" Kronha & Banzatto pg 112.

Parcela Sub-Dividida

No arquivo "exemplo07E.txt", estão os dados retirados do livro "Experimentação Agrícola" Kronha & Banzatto, este experimento foi conduzido em bloco ao acaso em parcela subdivididas, o tratamento principal foi adubos:

  1. A1-Salitre do Chile
  2. A2-Sulfato de amônio
  3. A3-Uréia
  4. A4-Calnitro

Como tratamento secundario foi adotado 3 Doses:

  1. D1- 10 kg de N/ha
  2. D2- 40 kg de N/ha
  3. D3- 70 kg de N/ha

Estes tratamentos foram avaliados na cultura do milho, onde como variavel resposta foi mensurado a produtividade em kg/ha. Obtenha: ANOVA, desdobramento da ANOVA, testes de comparação multiplas e conclusões sobre o experimento.

Experimento em faixas

O exemplo a seguir e retirados do livro "Experimentação Agrícola" Kronha & Banzatto pg 161, o experimento avaliou t/acre de beteraba submetida a 0,80,160 e 320 libras/acre de N e 5 épocas de plantio conduzidos em um experimento em faixas.

Experimento em faixas2

No arquivo "exemplo08E.txt" existem dados oriundos da produção de milho em kg/parcela em diferentes espaçamentos e diferentes densidades, sendo o experimento conduzido em faixas. Obtenha: ANOVA e as comparações multiplas caso for necessario.

Solução de alguns exercicios

Software e Pacotes

  • agricolae Implementa uma serie de funções interessantes em estatistíca experimental no R.
  • ScottKnott Executa o teste ScottKnott no R
  • nlme Pacote para análise de modelos mistos no R

Artigos e Teses Relacionadas

Organização e Promoção

Centro Academico de Agronomia Lycio Vellozo - UFPR

Apoio:

  • LEG: Laboratório de Estatística e Geoinformação
  • LABEST: Laboratório de Estatística
  • C3SL: Centro de Computação Científica e Software Livre

Localização

  • Local: LABEST - Laboratório de Estatística - Centro Politécnico - UFPR

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