Introdução ao Rcitrus

Elias T. Krainski & Paulo J. Ribeiro Jr

Última Atualização: 4 de agosto de 2006

Este trabalho descreve a funcionalidade do Rcitrus, software para análise de dados de incidência de doenças em plantas. O Rcitrus foi desenvolvido em estrutura de pacote adicional da linguagem R. Seu desenvolvimento foi motivado pela necessidade de automatizar a análise estatística de dados de morte súbita dos citrus. Foram implementados alguns procedimentos para análise do padrão espacial da incidência de doenças em um talhão. Para a análise por quadrat count, foram implementados os modelos de Poisson, binomial e beta-binomial, a lei de Taylor e dois procedimentos de seleção dos quadrats: sistemático ou aleatório. Para a análise por processos pontuais, foram adaptadas a técnica de suavização por kernel (simples e razão), a análise por vizinhos próximos e a função K de Ripley. Para a modelagem, foi implementado o modelo autologístico com inferência utilizando bootstrap via amostrador de Gibbs e o método de Monte Carlo. Também foram implementados cinco métodos para simulação de dados binários com dependência espacial. As funcionalidades do Rcitrus são demonstradas com dados de morte súbita dos citros.

1 Introdução
2 Dados de doenças de plantas em R
 2.1 Validação de dados
 2.2 Descrição de dados de doenças em plantas
3 Análise por quadrat counts
 3.1 Lei de Taylor
4 Análise dos vizinhos próximos
 4.1 Distância mínima média
 4.2 Número médio de vizinhos doentes
5 Análise de processos pontuais
 5.1 Suavização por kernel
 5.2 Função K de Ripley
6 Modelo autologístico
7 Simulando dados com padrão espacial
Agradecimentos
Referências