|
|
Defina-se distância mínima a distância entre uma planta e a planta doente mais próxima a ela. O número de vizinhos próximos dado um raio é o número de plantas doentes a menos da distância do raio da planta. Calculando-se estas estatísticas para cada planta doente, obtemos a distância mínima média entre plantas doentes e o número de vizinhos próximos de plantas doentes.
Para a análise, aplica-se um teste Monte Carlo, comparando o valor observado no conjunto de dados e com valores obtidos sob hipótese nula de aleatoriedade espacial completa. O p-valor no teste de distância mínima média é pela proporção de valores sob a hipótese nula menores ou iguais ao valor observado; no teste dos vizinhos próximos é dado pela proporção de valores sob hipótese nula, maiores ou iguais ao valor observado.
A função mmdist.test() faz a análise por distância mínima e recebe como entrada os dados no formato geodata, o código atribuido às plantas doentes e o número de simulações.
Carregando um conjuntode dados de morte súbita de Citrus.
Vendo os argumentos da função
Fazendo a análise:
Pode-se também fazer o histograma e o plot das distâncias (Figura 1) usando os comandos:
