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====== Coleção de Materiais sobre Métodos Computacionalmente Intensivos ======

==== Textos ====
   * {{projetos:mci:cimnotes.pdf|Notas sobre MCI}} 
   * {{projetos:mci:cimdata.r|arquivo compatível com R}} com dados das notas sobre MCI acima. Carregue no R com o comando:
<code R>
source("cimdata.r")
ls(pat=".dat")
</code>
 
   * {{projetos:mci:relacoesDistribuicoes.pdf|Grafo das relações entre distribuições univariadas}}
   * {{projetos:mci:tabelasPrioris.pdf|A Compendium of Conjugate Priors}}
   * {{projetos:mci:catalogNIPriors.pdf|Catalogo de Prioris não Informativas}}

==== Estudos ====
  *  Máxima Verossimilhança
  *  Inferência Bayesiana (em desenvolvimento)
    * {{projetos:mci:mci.rnw|Entendendo Inferência Bayesiana (Rnw/Tex)}}(28/08/2007) :!: Para compilar este arquivo há a necessidade de estar instalado o pacote 'mtable' no R.
    * {{projetos:mci:mci1.pdf|Entendendo Inferência Bayesiana (PDF)}}(28/08/2007)
 
  *  Um exemplo de Regressão Linear Simples 
     * Via Método de Reamostragem Ponderada (30/10/2007)
      *{{projetos:mci:dadosreglinear.txt|Dados da Tese de Edson A. A. Silva}}
      *{{projetos:mci:reglinear.rnw |Regressão Linear Simples via Reamostragem Ponderada (rnw/tex)}}      
      *{{projetos:mci:reglinear.pdf|Regressão Linear Simples via Reamostragem Ponderada (PDF)}} 
       * Via JAGS (12/11/07)
      *{{projetos:mci:dadregliponto.txt|Dados da Tese de Edson A. A. Silva (txt)}}
       *{{projetos:mci:reglijags.r|reglijags.r - Regressão Linear Simples, Arquivo mãe (.r)}}
      *{{projetos:mci:jags.r|jags.r - Arquivo que deve estar no mesmo diretório que reglijags.r }}
      *{{projetos:mci:reglijags.bug|reglijags.bug - Arquivo contendo o modelo (.bug)}}
      *{{projetos:mci:reglijags.cmd|reglijags.cmd - Arquivo criado por reglijags.r (.cmd)}} 
      *{{projetos:mci:reglijags-data.r|reglijags-data.r - Arquivo criado por reglijags.r (.r)}}
      *{{projetos:mci:reglijags-inits.r|reglijags-inits.r - Arquivo criado por reglijags.r (.r)}}
      *{{projetos:mci:codachain1.txt|codachain1.txt - Arquivo de saída, criado por reglijags.r (.txt)}}
      *{{projetos:codaindex.txt|codaindex.txt - Arquivo de saída, criado por reglijags.r (.txt)}}
     *Via UMacs (22/11/07)
      *{{projetos:mci:dadregliponto.txt|Dados da Tese de Edson A. A. Silva (txt)}}
      *{{projetos:mci:regliumacs.r|Regressão Linear Simples-UMacs (.R)}}
   *  Exemplos de Inferência Bayesiana 
    *{{projetos:mci:modelosnovo.pdf|Modelos Poisson e Espaciais (PDF)-Luiz}} (08/11/07)
   *  Estimação da precisão de um estimador via Bootstrap - Ana e Guerino (14/01/08)
    *{{projetos:mci:boot.r| boot.r - Precisão do estimador (.r)}}
      *{{projetos:mci:theta1.r| theta1.r - Arquivo utilizado em boot.r se o estimador é a média (.r)}}
      *{{projetos:mci:theta2.r| theta2.r - Arquivo utilizado em boot.r se o estimador é a mediana (.r)}}
      *{{projetos:mci:theta3.r| theta3.r - Arquivo utilizado em boot.r se o estimador é a variância (.r)}}
      *{{projetos:mci:theta4.r| theta4.r - Arquivo utilizado em boot.r se o estimador é a correlação (.r)}}
      *{{projetos:mci:theta5.r| theta5.r - Arquivo utilizado em boot.r se o estimador é a regressão (.r)}}
    *{{projetos:mci:boot1.r| boot1.r - Precisão do estimador - uma versão melhorada da anterior (.r)}}
    *{{projetos:mci:bootcor.r| bootcor.r - Precisão do estimador correlação-Ana (.r)}}
    *{{projetos:mci:bootcorg.r| bootcorg.r - Precisão do estimador correlação-Guerino (.r)}}
    *{{projetos:mci:regliboot.r| regliboot.r - Precisão do estimador regressão-Ana (.r)}}
    *{{projetos:mci:bootregg.r| bootregg.r - Precisão do estimador regressão-Guerino (.r)}}
    *{{projetos:mci:bootseminario.tex| Seminário sobre Boostrap (.tex)}}
  * Algoritmo EM  
    *{{projetos:mci:distmultiem.r| distmultiem.r - Algoritmo EM, Distribuição Multinomial (.r)}}
     *{{projetos:mci:emseminario.tex| emseminario.tex - Seminário sobre Algoritmo EM}}
    * Um exemplo de regressão linear via Algoritmo EM -Guerino 22/01/08
      *{{projetos:mci:dadosem.txt|dadosem.txt}}
      *{{projetos:mci:emh.r|emh.r}}
      *{{projetos:mci:ordem.r|ordem.r}}
      *{{projetos:mci:regressao_em.r|regressao_em.r}}    

==== Códigos ====
    -  Exemplos utilizando funcao MCMCmetrop1R() do pacote 'MCMCpack'
     * Modelo Normal com efeito aleatorio
        * {{projetos:mci:normalmix.Rnw|Modelo normal misto (.Rnw)}}
        * {{projetos:mci:normalmix.pdf|Modelo normal misto (.pdf)}}
     * Poisson
      * {{projetos:mci:poissonmix.R|Poisson (.R)}}
     * CAR
      * {{projetos:mci:car0.R|CAR (.R)}}
     * Geoestatistico
      * {{projetos:mci:geoest.R |Modelo geoestatistico (.R)}}


   - Simple linear regression using UMacs package
     * {{projetos:mci:lrumacs.r|Simple linear regression using UMacs package (.R)}} (08/11/07)

   - Modelos de Inferência Bayesiana via WinBugs
     *{{projetos:mci:modelos.zip|Modelos Poisson e Espaciais (.txt)-Luiz }} (08/11/07)
   

==== Referências ====
<bibtex> 
@Book{gilks+richardson+spiegelhalter:1996,
  author = 	 {Gilks, W. R. and Richardson, S. and Spiegelhalter, D. J. (Ed.)},
  title = 	 {Markov Chain Monte Carlo in Practice},
  publisher = 	 {Chapman and Hall},
  address = 	 {London},
  year = 	 {1996}}
@Book{moller:2003,
  author = 	 {Jasper M{\o}ller (Ed.)},
  title = 	 {Spatial Statistics and Computational Methods},
  publisher = 	 {Springer},
  year = 	 {2003},
  OPTkey = 	 {},
  OPTvolume = 	 {},
  OPTnumber = 	 {},
  series = 	 {Lecture Notes in Statistics},
  address = 	 {New York},
  OPTedition = 	 {},
  OPTmonth = 	 {},
  OPTnote = 	 {},
  OPTannote = 	 {}
}
@Book{gelman+carlin+stern+rubin:2003,
  author = 	 {Gelman, A. and Carlin, J. B. and Stern, H. S. and Rubin, D. B.},
  title = 	 {{B}ayesian Data Analysis},
  publisher = 	 {Chapman and Hall},
  address = 	 {London},
  edition =      {Second},
  year = 	 {2003}
}
@Book{lee:2004,
  author = 	 {Lee, Peter N.},
  title = 	 {Bayesian Statistics: an introduction},
  publisher = 	 {Arnold},
  address = 	 {London},
  edition =      {3},
  year = 	 {2004}
}
@Book{robert+casella:2004,
  author = 	 {Robert, Christian P. and Casella, George},
  title = 	 {Monte Carlo Statistical Methods},
  publisher = 	 {Springer},
  address = 	 {New York},
  edition =      {2},
  year = 	 {2004}
}
@Book{tanner:1996,
  author = 	 {Tanner, M.},
  title = 	 {Tools for Statistical Inference},
  publisher = 	 {Springer},
  address = 	 {New York},
  year = 	 {1996}
}
@Book{ohagan:1994,
  author = 	 {O'Hagan, A.},
  title = 	 {{B}ayesian Inference},
  publisher = 	 {Edward Arnold},
  year = 	 {1994},
  volume = 	 {2b},
  series = 	 {Kendall's Advanced Theory of Statistics}
}
@Book{lange:1999,
  author = 	 {Lange, Kenneth},
  title = 	 {Numerical Analysis for Statisticians},
  publisher = 	 {Springer},
  address = 	 {New York},
  year = 	 {1999}
}
@Article{metropolis+etal:1953,
  author = 	 {Metropolis, N. and Rosenbluth, A. W. and Rosenbluth, M. N. and Teller, A. H. and Teller, E.},
  title = 	 {Equations of state calculations by fast computing machine},
  journal = 	 {Journal of Chemical Physics},
  volume = 	 {21},
  pages = 	 {1087-1091},
  year = 	 {1953}
}
</bibtex>
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