====== CE008 - Introdução à Bioestatística ====== Bem-vindos à página wiki da disciplina CE008. Aqui ficarão disponíveis links para vídeos interessantes relacionados ao curso, as notas das avaliações e o planejamento de cada aula. O objetivo desta disciplina é conhecer os conceitos fundamentais de Estatística com aplicações em saúde. ===== Horário das Aulas ===== * **Turmas B e D:** Quinta-feira, 16:30-18:30, Sala 2C * **Turmas A e C:** Sexta-feira, 10:30-12:30, Sala 2C * **Local:** Setor de Ciências da Saúde * **Professora:** Silvia Shimakura (silvia.shimakura@ufpr.br) * **Sala da professora:** Laboratório de Estatística e Geoinformação (LEG), Centro Politécnico, UFPR ===== Localização e acesso ao LEG ===== O LEG encontra-se no segundo andar do novo prédio do setor de ciências exatas. O prédio é o primeiro à esquerda próximo ao portão de entrada do campus da BR-277. Clique [[http://maps.google.com/maps?f=q&source=s_q&hl=pt-BR&geocode=&q=LEG%2FUFPR&aq=&sll=-25.450691,-49.23435&sspn=0.012051,0.030448&g=-25.450419,-49.231754&ie=UTF8&ll=-25.450434,-49.231692&spn=0.001506,0.003806&t=h&z=19&iwloc=A|aqui]] para abrir a nossa localização em uma nova página com indicação. /* */ {{ :disciplinas:ce008:leg.png?direct&1000 |}} ===== Avaliações ===== Três avaliações de igual peso e o exame final. * Avaliação 1: 23/04 (Turmas B e D) e 24/04 (Turmas A e C) * Avaliação 2: 04/06 (Turmas B e D) e 05/06 (Turmas A e C) * Avaliação 3: Seminários em grupo (grupos de 4 ou 5 alunos). * Turmas B e D: 18/06, 25/06, 02/07 * Turmas A e C: 19/06, 26/06, 03/07 * Exame Final: * 09/07 e 10/07 Todo o conteúdo do semestre ===== Programa computacional ===== Utilizado para fins didáticos. Sistema de análise estatística [[http://www.r-project.org|R]] que é gratuito e de código aberto. [[https://rstudio.cloud| Você pode rodar o R online via RStudio Cloud.]] ===== Bibliografia ===== - Soares, J. F., Siqueira, A. L. (2002) Introducão à Estatística Médica. COOPMED. ISBN: 85-85002-55-7. - Reis, E.A.; Reis, I.A. (2001). Análise Descritiva de Dados - Tabelas e Gráficos. [[http://www.leg.ufpr.br/~silvia/CE055/rte0104.pdf|Relatório Técnico RTE-04/2001]], Depto Estatística-UFMG. - Colton, T. (1974). Statistics in Medicine. Little, Brown and Company. ===== Material do curso ===== Baseado no livro: Introdução à estatística médica (Soares & Siqueira, 2002). As aulas serão dadas no estilo tutorial e estão disponíveis para [[http://www.leg.ufpr.br/~silvia/CE008/ce008.pdf|download]]. ===== Tabelas ===== * [[http://www.leg.ufpr.br/~silvia/CE008/tabelasest.pdf|Tabelas das distribuições usadas neste curso]]. * [[http://www.leg.ufpr.br/~silvia/CE008/tabela-normal.pdf|Tabela da distribuição normal]]. ===== Planejamento das aulas ===== |Aula|Data|Conteúdo|Vídeos|Exercícios Propostos| |1|13/02; 14/02|Apresentação da página web da disciplina; apresentação da lista de conteúdos do curso, das datas e dos critérios das avaliações| | | |1|13/02; 14/02|Introdução: [[http://prezi.com/byybybfqpxac/introducao-a-bioestatistica/|Apresentação Prezi da disciplina]]; {{:disciplinas:ce008:estatistica_na_medicina.pdf|Slides com exemplos de estatística na Medicina}}|[[http://onlinestatbook.com/2/introduction/importanceM.html]]; [[http://www.youtube.com/watch?v=YHXadaW_lso|Material perdisco: vídeo introdutório sobre conceitos e temos básicos em estatística]]|Leitura Caps 1 e 2 do livro texto; [[http://onlinestatbook.com/2/introduction/ch1_exercises.html]]| |2|27/02; 28/02|Estatística Descritiva:[[http://www.leg.ufpr.br/~silvia/CE008/node6.html| Tabelas e Gráficos]]; {{:disciplinas:ce008:descritiva.pdf|Estatística Descritiva}}|[[http://onlinestatbook.com/2/graphing_distributions/graphing_distributions.html]]; [[http://www.youtube.com/watch?v=qKPhtBIsyIY|Material perdisco: Chapter 2: Presenting data]]|Leitura Cap 3 do livro texto; [[http://onlinestatbook.com/2/graphing_distributions/ch2_exercises.html]]; {{:disciplinas:ce008:lista1.pdf|}}| |3 e 4|05/03; 06/03; 12/03; 13/03| Estatística Descritiva: [[http://www.leg.ufpr.br/~silvia/CE008/node18.html| Resumos numéricos]]; {{:disciplinas:ce008:descritiva.pdf|Estatística Descritiva}}|[[http://onlinestatbook.com/2/summarizing_distributions/summarizing_distributions.html]]; [[http://www.youtube.com/watch?v=NIhU9HB1NwM|Material perdisco: Chapter 3: Measuring data]]| [[http://onlinestatbook.com/2/summarizing_distributions/ch3_exercises.html]] {{:disciplinas:ce008:exer.pdf|Lista de exercícios}}; {{ :disciplinas:ce008:exer-respostas.pdf |Respostas da lista de exercícios}}; Códigos em R usados na aula: {{:disciplinas:ce008:medidas.r|}}; {{:disciplinas:ce008:exe3.11.r|}}; {{:disciplinas:ce008:exe3.18.r|}} ; 8-) [[https://create.kahoot.it/share/kahoot-for-formative-assessment/422b94aa-88c7-4d38-9d09-dd51aae2f8d9|DESAFIO: QUIZ para os fortes!]]| |5 e 6|19/03; 20/03; 26/03; 27/03|Probabilidade: {{:disciplinas:ce008:probabilidade.pdf|}}; [[http://www.leg.ufpr.br/~silvia/CE008/node28.html|Introdução à probabilidade e aplicação a testes diagnósticos]];{{:disciplinas:ce008:estatistica.pdf|Slides 19 a 36}}|[[http://onlinestatbook.com/2/probability/probability.html]]; [[http://www.youtube.com/watch?v=rhOTjLOPWbU|Material perdisco: Chapter 4: Probability]]|Leitura Cap 4 do livro texto; [[http://onlinestatbook.com/2/probability/ch5_exercises.html]]; {{:disciplinas:ce008:exercicios-probabilidade.pdf|Exercícios de probabilidade}}| |7 e 8|02/04; 03/04; 16/04; 17/04|Distribuições de probabilidade: {{:disciplinas:ce008:estatistica.pdf|Slides 37 a 69}} {{ :disciplinas:ce008:distbinom.r |}}; [[http://www.leg.ufpr.br/~silvia/CE008/node45.html|Construção de faixas de referência]]|[[http://onlinestatbook.com/2/probability/binomial.html]]; [[http://onlinestatbook.com/2/normal_distribution/normal_distribution.html]] | {{:disciplinas:ce008:exercicios-distnormal.pdf|Exercícios distribuição normal}} {{:disciplinas:ce008:exercicios-distnormal-respostas.pdf|}} {{:disciplinas:ce008:errata.pdf|errata (item b, Questão 3)}}; Leitura Cap 5 do livro texto.| |9|23/04; 24/04| **Prova 1** e Sorteio da ordem de apresentação dos seminários| Conteúdo: Estatística descritiva, Probabilidade; Distribuições binomial e normal |Tipos de variáveis; Interpretação de gráficos; Cálculo de medidas resumo (média, moda, quartis, percentis, variância, desvio-padrão, coeficiente de variação, escore padronizado); Cálculo de probabilidades e medidas de qualidade de testes diagnósticos: sensibilidade, especificidade, VPP, VPN, Distribuição binomial e normal| |10 e 11|07/05; 08/05; 14/05; 15/05|Distribuição da média amostral; Teorema Central do Limite; Intervalo de confiança para uma média e uma proporção; Dimensionamento de amostras; {{ :disciplinas:ce008:intervalo-confianca.pdf |}} {{:disciplinas:ce008:distamostral.r|}}{{ :disciplinas:ce008:intervalo-proporcao.r |}}|Leitura do Cap 7 do livro texto. [[http://onlinestatbook.com/2/sampling_distributions/sampling_distributions.html]]; [[http://onlinestatbook.com/2/sampling_distributions/clt_demo.html]]; [[http://onlinestatbook.com/2/sampling_distributions/samp_dist_mean.html]]; |[[http://onlinestatbook.com/2/sampling_distributions/ch7_exercises.html]]| |12 e 13|21/05; 22/05; 28/05; 29/05|Teste de hipóteses para uma média {{:disciplinas:ce008:estatistica.pdf|Slides 82 a 97}}; {{ :disciplinas:ce008:distamostral.r |}}|[[http://onlinestatbook.com/2/tests_of_means/t_distribution_demo.html]][[http://onlinestatbook.com/2/estimation/estimation.html]]; [[http://onlinestatbook.com/2/estimation/mean.html]]; [[http://onlinestatbook.com/2/estimation/ci_sim.html]]; [[https://youtu.be/igi7E1OY7gs|Como funciona uma pesquisa eleitoral]] | Leitura do Cap 6 do livro texto;[[http://onlinestatbook.com/2/logic_of_hypothesis_testing/logic_hypothesis.html]]; [[http://onlinestatbook.com/2/tests_of_means/single_mean.html]]; Seção 7.2 livro texto; [[http://onlinestatbook.com/2/estimation/ch8_exercises.html]]; [[http://onlinestatbook.com/2/logic_of_hypothesis_testing/ch9_exercises.html]]; [[http://onlinestatbook.com/2/tests_of_means/ch10_exercises.html]]| |14|04/06; 05/06| **Prova 2** | Conteúdo: Distribuição amostral da média; Intervalos de confiança para médias e proporções; Teste de hipóteses para uma média, Dimensionamento de amostras| | |15|18/06; 19/06| Seminários 1| | | |16|25/06; 26/06| Seminários 2| | | |17|02/07; 03/07| Seminários 3| | | | |09/07; 10/07| Exame Final | Conteúdo: Todo o conteúdo do semestre | | ===== Temas dos Seminários ===== Nos seminários os grupos apresentarão artigos contendo análise estatística envolvendo um dos métodos abaixo: - Intervalos de confiança para a diferença de médias de dois grupos independentes - Teste t para comparação de médias de dois grupos independentes - Teste Z para comparação de médias de dois grupos independentes - Teste U de Mann-Whitney - Intervalos de confiança para a diferença de médias de dois grupos pareados - Teste t para comparação de médias de dois grupos pareados - Teste de Wilcoxon - Teste Qui-quadrado - Teste Exato de Fisher - Teste de McNemar ===== Cronograma dos Seminários ===== **Entregar uma cópia impressa dos slides** para a professora no dia da apresentação do seu grupo. A não apresentação da cópia impressa acarretará em desconto na nota do grupo. A falta nos seminários acarretará em desconto na nota individual do aluno. TEMPO DE APRESENTAÇÃO: máximo 20 MIN * Cronograma: ficará aqui * A apresentação deve incluir: * Teoria sobre o método estatístico que será apresentado * Uma ou duas aplicações do método para exemplificar seu uso ===== Notas das Avaliações ===== * Notas 2o. semestre 2019: Ficarão aqui ===== Slides usados em aula ===== * {{:disciplinas:ce008:estatistica.pdf|Slides do curso de Bioestatística}} * {{:disciplinas:ce008:probabilidade.pdf|Slides das aulas de probabilidade}} * {{:disciplinas:ce008:distribuicao-amostral.pdf|Distribuição amostral da média}} * {{:disciplinas:ce008:distamostral.r|}} * {{:disciplinas:ce008:ce008.pdf|Apostila de CE008 - Material da página da disciplina}} * {{ :disciplinas:ce008:teste_de_hipoteses.pdf |Slides da aula de revisão para a prova 2 de Erik O. L. Andersen}} ===== Exercícios Resolvidos ===== * Reis, E.A.; Reis, I.A. (2000). Exercícios resolvidos em Introducão à Bioestatística. Relatório Técnico [[http://www.leg.ufpr.br/~silvia/CE055/rte0003.pdf|RTE-03/2000]], Depto Estatística-UFMG. ===== Gabaritos das Provas ===== * 1o. semestre 2011: {{:disciplinas:gabarito-prova1v1.pdf|Prova 1}} {{:disciplinas:gabarito-prova1v2.pdf|Prova 1}} {{:disciplinas:gabarito-prova2v1.pdf|Prova 2}} {{:disciplinas:gabarito-prova2v2.pdf|Prova 2}} * 1o. semestre 2012: {{:disciplinas:ce055:gabarito.prova1.pdf|Prova 1}} * 1o. semestre 2014: {{:disciplinas:ce008:prova1a-sem2014-gabarito.pdf|Prova 1}} {{:disciplinas:ce008:prova1b-sem2014-gabarito.pdf|Prova 1}} * 1o. semestre 2015: {{:disciplinas:ce008:prova2quinta-gabarito.pdf|Prova 2}} {{:disciplinas:ce008:prova2sexta-gabarito.pdf| Prova 2}} ===== Materiais didáticos online ===== * [[https://www.youtube.com/playlist?list=PLTtZUJqLYbCl9oBV_22ycFJsVeddG4ixd|KHAN ACADEMY EM PORTUGUÊS]] * [[http://www.math.csi.cuny.edu/Statistics/R/simpleR/]] * [[http://onlinestatbook.com/2/]] * [[http://www.perdisco.com/stats/videos/default.aspx]] * [[http://www.veduca.com.br/assistir/probabilidade-e-estatistica|Curso: Probabilidade & Estatística]] * [[http://www.veduca.com.br/assistir/probabilidade-para-ciencias-medicas|Curso: Probabilidade para Ciências Médicas]] * [[http://www.veduca.com.br/assistir/estatistica-basica|Curso: Estatística Básica]] * [[http://www.veduca.com.br/assistir/visualizando-dados|Visualizando dados]] * [[https://lagunita.stanford.edu/courses/Medicine/MedStats./Summer2015/about|Statistics in Medicine, Universidade de Harvard]] ===== Artigos sugeridos ===== * [[http://stanmed.stanford.edu/2012summer/article2.html|Statistically Significant: Biostatistics is blooming. KRISTIN SAINANI, Stanford Meds: Special Report, 1012]] * {{:disciplinas:ce008:984statisticalliteracy6.pdf|Statistical literacy}} * Usos e Abusos do valor-p: * {{:disciplinas:ce008:506150a.pdf|Scientific method: Statistical errors. P values, the 'gold standard' of statistical validity, are not as reliable as many scientists assume. Regina Nuzzo (12 February 2014).}}, Nature, 506, 150-152. (web-page:[[http://www.nature.com/news/scientific-method-statistical-errors-1.14700]]) * Wasserstein, R.L. & Lazar, N.A. (2016), "The ASA's statement on p-values: context, process, and purpose", The American Statistician, DOI:10.1080/00031305.2016.1154108 * Ioannidis JPA (2005) {{:disciplinas:ce008:pmed.0020124.pdf|Why Most Published Research Findings Are False.}} PLoS Med 2(8): e124. doi:10.1371/journal.pmed.0020124. * 5 year mortality predictors in 498 103 UK Biobank participants: a prospective population-based study. Andrea Ganna, Erik Ingelsson. The Lancet, Volume 386 , Issue 9993 , 533 – 540, 2015. [[http://www.thelancet.com/pdfs/journals/lancet/PIIS0140-6736(15)60175-1.pdf]]. DOI: http://dx.doi.org/10.1016/S0140-6736(15)60175-1. [[http://www.ubble.co.uk/|Ubble: UK Longevity Explorer web site]] ===== Vídeos sugeridos ===== * [[http://www.ted.com/talks/hans_rosling_shows_the_best_stats_you_ve_ever_seen.html|Hans Rosling mostra as melhores estatísticas que você já viu]] * [[http://www.youtube.com/watch?v=iG9CE55wbtY&list=LPPSfezl33bKA&index=2&feature=plcp|Sir Ken Robinson: Do schools kill creativity?]] * [[http://www.youtube.com/watch?v=zDZFcDGpL4U|RSA Animate - Changing Education Paradigms]] * [[http://www.youtube.com/watch?v=I1A4OGiVK30&feature=related|Sir Ken Robinson: Educating the Heart and Mind ]] * [[http://www.youtube.com/watch?v=hVimVzgtD6w|Hans Rosling: Stats that reshape your world-view]] * [[http://www.youtube.com/watch?v=ax7yGMuH1iE&feature=related|Gapminder.org]] * [[http://prezi.com/yod1-czcbno_/from-assignment-to-research-question/|from Assignment to Research Question]] * [[https://youtu.be/ySPm3boeO4c|Promotional video for Statistics in Medicine at Harvard]]